Durante 12 números, las Tortugas Ninja se han enfrentado a un desafío tras otro al ser separadas, acusadas de asesinato y llevadas a juicio como los villanos más grandes de la ciudad de Nueva York. La lucha por limpiar sus nombres y finalmente sanar a su familia se reduce a esto, ya que nada se interpone entre las Tortugas y su libertad... excepto una amenaza como ninguna que hayan enfrentado jamás.