Durante 12 números, las Tortugas Ninja han enfrentado desafío tras desafío al ser separadas, acusadas de asesinato y llevadas a juicio como los villanos más grandes de la ciudad de Nueva York. La lucha por limpiar sus nombres y finalmente sanar a su familia se reduce a esto, ya que nada se interpone entre las Tortugas y su libertad… excepto una amenaza como ninguna que hayan enfrentado antes.